Черноголовый питон является стройной змеёй с относительно маленькой головой. На его морде нет теплоулавливающих ямок, что отличает его от всех питонов, кроме самой близкого родственника, австралийского питона Рамсея, A. ramsayi. Отсутствие теплоулавливающих ямок может быть результатом предпочтения холоднокровной добычи. Он питается в основном другими рептилиями, включая ядовитых змей, но иногда ловит мелких зверей и птиц.
Это наземный вид, который использует расселины скал, полые бревна, и заброшенные звериные норы для укрытия. Хотя он активен в основном по ночам, он может выползти и днём в прохладную погоду. Самки кладут яйца под бревна или корни, и в подземные норы. Как и большинство питонов, они сворачиваются вокруг яиц и защищают их и регулируют их температуру пока они не вылупятся, что может занять 60-80 дней.