|
|
||
Надеюсь, что со временем удастся навести порядок в оформлении параграфа. |
Курсив не нужно зубрить.
Для чего активность ферментов нужно регулировать?
За счет чего активность ферментов может изменяться?
6. 1. Ф и з и ч е с к и е механизмы регуляции (3.).
6.1. 1. И з о с т е р и ч е с к и й механизм.
6. 1. 2. А л л о с т е р и ч е с к и й механизм.
И з о стерические и а л л о стерические регуляторы.
N |
Тип регулятора и название механизма |
изостерический |
аллостерический |
1. |
П е р е в о д |
"то же место" (в АЦ) |
Другое место (центр) |
2. |
В каком ЦЕНТРЕ связывается с молекулой фермента |
В активном центре |
В аллостерическом |
3. |
Может ли быть активатором |
Нет (т.к. занял АЦ) |
да |
4. |
Может ли быть ингибитором |
да |
|
5. |
Подобен ли по свойствам субстрату |
да |
Нет |
6. |
Конкурирует ли за связывание в АЦ с субстратом |
да |
Нет |
7. |
(Для ингибиторов) конкурентный или нет |
конкурентный |
Неконкурентный |
8. |
Как оказывается в организме |
Поступает извне (яд или лекарство) |
Вырабатывается в клетке |
П р и з н а к и конкурентных и неконкурентных ингибиторов (обратимых).
1. |
Типы ингибиторов |
Конкурентный ингибитор |
Неконкурентный ингибитор |
2. |
Подобен ли субстрату по свойствам (по размеру и т.д.) |
Подобен субстрату (и поэтому конкурирует с ним) |
Неподобен субстрату |
2.2 |
Конкурирует ли с субстратом за связывание в АЦ (из-за сходства) |
Д а (т.к. похож на субстрат) |
Н е т |
3. |
В каком ц е н т р е молекулы фермента связывается |
В а к т и в н о м центре |
Не в активном центре, а в другом: в а л л о с т е р и ч е с к о м |
4. |
По какому из физических механизмов действует |
По и з о с т е р и ч е с к о м у (т.к. связывается в АЦ) |
По а л л о с т е р и ч е с к о м у |
5. |
Как изменяется Км |
Увеличивается |
Не изменяется |
6. |
Вытесняется ли из АЦ субстратом см. 6.2 |
Да |
Н е т (ингибитора нет в АЦ) |
6.2 |
Снимается ли ингибирование добавлением субстрата из-за вытеснения |
Д а |
Н е т |
7. |
Как ингибитор может попасть в клетку (пути поступления) |
Обычно э к з о г е н н о (лекарство или яд) |
Может быть экзогенным, но обычно образуется в самой клетке (продукты процессов*) |
8. |
в качестве лекарств могут назначаться раз в сутки или раз в неделю |
Р а з в с у т к и (или несколько раз) |
Р а з в н е д е л ю (или несколько раз) |
К л а с с и ф и к а ц и я и н г и б и т о р о в .
О б р а т и м ы е |
Н е о б р а т и м ы е |
||
1. |
П р о ч н о ли связываются ли с ферментом |
Н е п р о ч н о |
П р о ч н о |
2. |
М е н я ю т ли необратимо молекулу фермента |
Н е т |
Д а |
3. |
На какие д в е г р у п п ы делятся |
Конкурентные и неконкурентные |
- |
6. 1. 3-й физичекий механизм регуляции: в з а и м о д е й с т в и е б е л о к - б е л о к (ВД ББ).
3.1.
3.2.
3.2.1.
3.2.2.
Взаимодействие белок-белок (Б-Б): белка-регулятора и регулируемого белка (в т.ч. фермента).
1. |
Олигомер или нет? |
Белок-регулятор и регулируемый белок являются частями (субъединицами) одной молекулы (олигомера) или нет? |
||
2. |
Названия механизмов |
Если нет, то это - межмолекулярное взаимодействие ББ |
Если да, то это - внутримолекулярное взаимодействие ББ. (Регулятор и регулируемый являются субъединицами олигомера). |
|
3. |
Олигомер есть постоянно или нет? (для внутримолек.) |
-- |
Олигомер существует постоянно или регулярно распадается (на субъединицы)? (То есть - изменяется олигомерность или нет). |
|
4. |
Названия механизмов |
-- |
Если олигомер существует постоянно, то - "без изменения олигомерности". |
Если олигомер регулярно распадается и собирается вновь, то - "с изменением олигомерности". |
5. |
П р и м е р ы |
ВД Б-Б между пептидазами и их ингибиторами (анти/пептидазами): пептидаза + анти/пептидаза = = неактивный комплекс |
Тетрамер г е м о г л о б и н а (внутри эритроцитов транспортирует кислород из легких к клеткам организма и помогает транспорту СО2) |
Тетрамер протеинкиназы А 2 СЕ работают (каталитические), когда НЕ связаны с 2-мя другими СЕ (регуляторными) |
6. |
Белок-регулятор |
Антипептидазы = АП |
Все 4 субъединицы |
Регуляторные СЕ |
7. |
Регулятор активирует или ингибирует |
И н г и б и р у е т , поэтому приставка анти- |
А к т и в и р у е т (взаимная активация) |
И н г и б и р у е т |
8. |
Олигомер активнее или нет, чем СЕ |
-- (но комплекс неактивен) |
Тетрамер активнее, чем СЕ и чем глобула миоглобина |
Тетрамер не активен |
9. |
+ или - кооперативность (для олигомеров) |
--- (нет олигомера) |
Положительная (субъединицы активируются: 4 СЕ работают как 400 одиночных) |
отрицательная |
10 |
Без регулятора (патология) |
Цирроз и фиброз легких (при мутации гена АП) |
Не хватало бы О2 без + кооперативности |
Работали бы все время каталитические (плохо) |
В гемоглобине и в протеинкиназе кооперативность такая, какая указана. Но в других олигомерах может быть иначе.
6. 2. Х и м и ч е с к и е механизмы регуляции ферментов.
6. 2. 1. (4-й механизм регуляции). Химическая м о д и ф и к а ц и я .
Присоединение фосфата
Отщепляется фосфат в виде Н3РО4.
С р а в н е н и е фосфорилирования и ДЕфосфорилирования.
N |
Название процесса |
фосфорилирование |
дефосфорилирование |
1. |
Определение процесса |
Присоединение фосфата |
Отщепление фосфата |
2. |
Форма фосфата, участвующего в реакции |
АТФ (источник фосфата) |
Н3РО4 |
3. |
Способ присоединения или отщепления фосфата |
Перенос от АТФ , превра-щающегося при этом в АДФ |
Расщепление связи с фосфатом путем гидролиза |
4. |
Фермент какого класса катализирует реакцию |
Трансферазы (переносчики) |
гидролазы |
5. |
Подкласс фермента, катализирующего реакцию |
Киназы= фосфоТФ |
Фосфатазы (эстеразы) |
6. |
Ферменты, катализирующие фосфорилирование и дефосфорилирование белков (=протеинов) |
Протеин- Киназы = ПК |
(фосфо)протеин- Фосфатазы = ПФ |
6. 2. 2. (5-й механизм регуляции активности). О г р а н и ч е н н ы й п р о т е о л и з (ОП).
О г р а н и ч е н н ы й п р о т е о л и з (ОП). См. п. 83.
С у б с т р а т ОП (пре- или -ген) |
П р о д у к т ОП |
||||
1. |
ППЦ длиннее или короче |
длиннее |
короче |
||
2. |
АЦ может сформироваться или не может |
НЕ может |
может |
||
3. |
Молекула белка активна или не активна (см. 2) |
не активна |
активна |
||
4. |
примеры |
П и щ е в а р и т е л ь н ы е пептидазы |
Препепсин (= пепсиноген) |
П е п с и н |
|
5. |
Претрипсин (= трипсиноген) |
Т р и п с и н |
|||
6. |
Из противосвертывающей системы крови |
плазминоген |
плазмин |
||
7. |
Из сворачивающей системы крови |
тромбиноген |
тромбин |
||
8. |
Калликреин-кининовая система |
Фермент |
Прекалликреин |
Калликреин |
|
|
гормон |
Прекинины (= кининогены) |
Брадикинин |
||
10. |
Г о р м о н ы |
П р о и н с у л и н |
И н с у л и н |
||
11. |
|
Про/опио/мелано/кортин |
АКТГ, эндорфины, др. |
|
Новые книги авторов СИ, вышедшие из печати:
О.Болдырева "Крадуш. Чужие души"
М.Николаев "Вторжение на Землю"